序列比對指將兩個或多個序列排列在一起,標明其相似之處。序列中可以插入間隔(通常用短橫線“-”表示)。對應的相同或相似的符號(在核酸中是A, T(或U), C, G,在蛋白質中是氨基酸殘基的單字母表示)排列在同一列上。 tcctctgcctctgccatcat---caaccccaaagt ||||...
4 KB (679 words) - 11:51, 25 August 2023
多重序列比對(Multiple sequence alignment;MSA)是對三個以上的生物學序列(biological sequence),如蛋白質序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比對。一般來說,是輸入一組假定擁有演化關係的序列。從MSA的結果可推導出序列...
3 KB (304 words) - 11:38, 31 August 2021
序列組裝(Sequence assembly)是生物資訊學中的一種分析方法。此方法通過序列比對和序列合併等演算,將短片段的DNA建構成為較長的連續序列。此技術的創立,是因為被測序的核酸分子通常長度都遠大於目前存在的DNA測序技術。而此分析能試圖從有限長度的DNA測序結果,重建出原本被測序分子的樣貌。...
23 KB (1,454 words) - 17:20, 18 September 2023
(以樹形基礎的一致性做多重序列比對) 是利用漸進似演算法來作多重序列比對的軟體 。 它利用兩兩序列比對所產生的資訊來進行多重序列比對。 在最新的版本 (3D-Coffee) 中,亦可結合結構的資訊來作多重序列比對。 此外,該軟體可以評估比對結果的品質及找出在比對中所出現特殊的模板 (Mocca)。 預設比對結果輸出的格式為...
5 KB (539 words) - 01:08, 10 December 2020
保守序列(英語:conserved sequences)在生物学中是指在核酸序列(如RNA及DNA序列)、蛋白质序列、蛋白质结构或多聚糖序列内相似或相同的序列,这种情况可以发生在各物种间(种间同源序列)或由相同生物产生的不同分子(种内同源序列)间。对于物种间保守的情况,这意味着尽管物种形成一些特定...
14 KB (1,695 words) - 00:59, 18 December 2020
作戰序列(Order of battle,縮寫ORBAT或OOB,又譯為戰鬥序列),是軍事情報單位用以表列及分析敵軍兵力佈署的方法。作戰序列應該與戰場上預期將會遭遇到的敵方軍情狀況相關,作戰序列將會分析敵方的單位、人員以及裝備。 作戰序列也被歷史學家以及戰棋玩家用來列出參戰雙方的組織與結構。...
6 KB (353 words) - 08:34, 20 February 2023
Clustal是一类用于多重序列比對的生物信息学计算机程序。 Clustal软件有如下几个版本: Clustal:最早的版本,由Des Higgins在1988年发表 ClustalV:Clustal的第二个版本,1992年发布 ClustalW:Clustal的第三个版本,1994年发布...
3 KB (268 words) - 07:53, 6 February 2024
Pfam是一個蛋白質家族資料庫。此資料庫會利用隱馬爾可夫模型進行多重序列比對以及加上蛋白腳註。 Pfam中所登錄的每一個蛋白質家族可以: 查詢多重序列比對 查看蛋白質主要結構 檢視物種演化樹 連結其他資料庫 查看已知的蛋白質結構 Pfam內的蛋白質家族描述由維基百科使用者管理。 Pfam的最新版本是「Pfam...
5 KB (467 words) - 17:20, 7 December 2023
序列分析是指通过一定的方法确定DNA上核苷酸排列的顺序,包括序列比对。序列分析是分子生物学的重要技术之一。 序列比对 Sequence analysis - 123 Genomics Nucleic sequence analysis - 巴斯德研究院...
600 bytes (40 words) - 10:10, 21 February 2018
序列、三维结构及生物学功能。 蛋白质家族的相似性中,最重要的是序列相似性(通常是氨基酸序列),因为它是同源的最严格指标,因此是共同祖先的最清晰的指标。使用序列比对方法评估一组序列之间的相似性的重要性存在相当完善的框架。不共享共同祖先的蛋白质不太可能显示统计学上显着的序列相似性,使序列比对成为识别蛋白质家族成员的有力工具。...
10 KB (1,424 words) - 05:45, 29 August 2024
ANSI转义序列(ANSI escape sequences)是一种带内信号(英语:In-band signaling)的转义序列标准,用于控制视频文本终端上的光标位置、颜色和其他选项。在文本中嵌入确定的字节序列,大部分以ESC转义字符和"["字符开始,终端会把这些字节序列解释为相应的指令,而不是普通的字符编码。...
63 KB (3,470 words) - 09:09, 16 September 2023