Baumann führte ab 2002 Regie in diversen Sketchen von Anke EngelkesLadykracher, ebenso 2003 bei der Fernsehserie Ohne Worte und 2005 und 2006 in weiteren Fernsehserien, wie LiebesLeben, Kinder, Kinder oder Die Abstauber – Herrenjahre sind keine Lehrjahre. 2006 arbeitete er in der Serie Ladyland wieder mit Anke Engelke zusammen. 2004 drehte Tobi Baumann seinen ersten Kinofilm Der WiXXer, unter anderem mit Bastian Pastewka, Oliver Kalkofe, Anke Engelke und Olli Dittrich. Baumanns zweiter Film Vollidiot mit Oliver Pocher in der Hauptrolle lief 2007 in den Kinos an.
Für das WatchblogBildblog drehte Baumann zusammen mit Anke Engelke und Christoph Maria Herbst einen Werbespot, der am 23. August 2007 erstmals ausgestrahlt wurde. Außerdem führte er in dem 2008 erstmals ausgestrahltem TV-Film Zwei Weihnachtsmänner Regie.
Im Sommer 2012 sollte er die Dreharbeiten zu Caius und der Gladiator leiten, einer Verfilmung der Kinderbuch-Reihe Caius, der Lausbub aus dem alten Rom,[2] deren Drehbuch sich hauptsächlich auf den Band Caius geht ein Licht auf bezieht. Das Projekt wurde dann nie umgesetzt.
Von 2012 bis 2013 führte Baumann Regie in Add a Friend, der ersten eigenproduzierte Serie eines deutschen Pay-TV-Senders. Die Serie erhielt 2013 einen Grimme-Preis in der Kategorie Fiktion Spezial.
Manfred Hobsch, Ralf Krämer, Klaus Rathje: Filmszene D. Die 250 wichtigsten jungen deutschen Stars aus Kino und TV. Schwarzkopf & Schwarzkopf, Berlin 2004, ISBN 3-89602-511-2, S. 29 f.