Histona deacetilasa 3 , la enciclopedia libre

Histona deacetilasa 3
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Buscar ortólogos: PDBe, RCSB

 Lista de códigos PDB
4A69
 Estructuras enzimáticas
Identificadores
Símbolos HDAC3 (HGNC: 4854) RPD3; HD3; RPD3-2
Identificadores
externos
Número EC 3.5.1.98
Locus Cr. 5 q31.3
Patrón de expresión de ARNm
ancho=250px
Más información
Ortólogos
Especies
Humano Ratón
Entrez
8841 15183
Ensembl
Véase HS Véase MM
UniProt
O15379 Q3UM33
RefSeq
(ARNm)
NM_003883 NM_010411
RefSeq
(proteína) NCBI
NP_003874 NP_034541
Ubicación (UCSC)
Cr. 5:
141 – 141.02 Mb
Cr. 18:
37.94 – 37.95 Mb
PubMed (Búsqueda)
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[2]

La histona deacetilasa 3 (HDAC3) es una enzima codificada en humanos por el gen hdac3.[1][2]

Función

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Las histonas juegan un papel crucial en la regulación de la transcripción, en la progresión del ciclo celular y en procesos de desarrollo. La acetilación/desacetilación de histonas altera la estructura del cromosoma, variando así la accesibilidad de los factores de transcripción al ADN. La HDAC3 pertenece a la familia de histona deacetilasas acuc/alfa. Esta proteína tiene actividad histona deacetilasa y reprime la transcripción cuando se une a los promotores diana. Podría participar en la regulación de la transcripción a través de su unión con el factor de transcripción con dedos de zinc YY1. HDAC3 también puede reprimir la función de p53 y así modular la proliferación celular y la apoptosis. El gen hdac3 es un potencial supresor tumoral.[3]

Interacciones

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La histona deacetilasa 3 ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

Véase también

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Referencias

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  1. Emiliani, S.; Fischle, W.; Van Lint, C.; Al-Abed, Y.; Verdin, E. (17 de marzo de 1998). «Characterization of a human RPD3 ortholog, HDAC3». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 95 (6): 2795-2800. ISSN 0027-8424. PMID 9501169. doi:10.1073/pnas.95.6.2795. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  2. Dangond, F.; Hafler, D. A.; Tong, J. K.; Randall, J.; Kojima, R.; Utku, N.; Gullans, S. R. (26 de enero de 1998). «Differential display cloning of a novel human histone deacetylase (HDAC3) cDNA from PHA-activated immune cells». Biochemical and Biophysical Research Communications 242 (3): 648-652. ISSN 0006-291X. PMID 9464271. doi:10.1006/bbrc.1997.8033. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  3. «Entrez Gene: HDAC3 histone deacetylase 3». 
  4. Petrie, Kevin; Guidez, Fabien; Howell, Louise; Healy, Lyn; Waxman, Samuel; Greaves, Mel; Zelent, Arthur (2 de mayo de 2003). «The histone deacetylase 9 gene encodes multiple protein isoforms». The Journal of Biological Chemistry 278 (18): 16059-16072. ISSN 0021-9258. PMID 12590135. doi:10.1074/jbc.M212935200. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  5. Zhou, X.; Richon, V. M.; Rifkind, R. A.; Marks, P. A. (1 de febrero de 2000). «Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 97 (3): 1056-1061. ISSN 0027-8424. PMID 10655483. doi:10.1073/pnas.97.3.1056. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  6. a b c Fischle, W.; Dequiedt, F.; Fillion, M.; Hendzel, M. J.; Voelter, W.; Verdin, E. (21 de septiembre de 2001). «Human HDAC7 histone deacetylase activity is associated with HDAC3 in vivo». The Journal of Biological Chemistry 276 (38): 35826-35835. ISSN 0021-9258. PMID 11466315. doi:10.1074/jbc.M104935200. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  7. a b Fajas, Lluis; Egler, Viviane; Reiter, Raphael; Hansen, Jacob; Kristiansen, Karsten; Debril, Marie-Bernard; Miard, Stéphanie; Auwerx, Johan (Diciembre de 2002). «The retinoblastoma-histone deacetylase 3 complex inhibits PPARgamma and adipocyte differentiation». Developmental Cell 3 (6): 903-910. ISSN 1534-5807. PMID 12479814. doi:10.1016/s1534-5807(02)00360-x. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  8. Lai, A.; Lee, J. M.; Yang, W. M.; DeCaprio, J. A.; Kaelin, W. G.; Seto, E.; Branton, P. E. (Octubre de 1999). «RBP1 recruits both histone deacetylase-dependent and -independent repression activities to retinoblastoma family proteins». Molecular and Cellular Biology 19 (10): 6632-6641. ISSN 0270-7306. PMID 10490602. doi:10.1128/MCB.19.10.6632. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  9. Nicolas, E.; Ait-Si-Ali, S.; Trouche, D. (1 de agosto de 2001). «The histone deacetylase HDAC3 targets RbAp48 to the retinoblastoma protein». Nucleic Acids Research 29 (15): 3131-3136. ISSN 1362-4962. PMID 11470869. doi:10.1093/nar/29.15.3131. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  10. Li, Guangjin; Franco, Peter J.; Wei, Li-Na (17 de octubre de 2003). «Identification of histone deacetylase-3 domains that interact with the orphan nuclear receptor TR2». Biochemical and Biophysical Research Communications 310 (2): 384-390. ISSN 0006-291X. PMID 14521922. doi:10.1016/j.bbrc.2003.08.145. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  11. a b c Franco, Peter J.; Li, Guangjin; Wei, Li-Na (29 de agosto de 2003). «Interaction of nuclear receptor zinc finger DNA binding domains with histone deacetylase». Molecular and Cellular Endocrinology 206 (1-2): 1-12. ISSN 0303-7207. PMID 12943985. doi:10.1016/s0303-7207(03)00254-5. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  12. Franco, P. J.; Farooqui, M.; Seto, E.; Wei, L. N. (Agosto de 2001). «The orphan nuclear receptor TR2 interacts directly with both class I and class II histone deacetylases». Molecular Endocrinology (Baltimore, Md.) 15 (8): 1318-1328. ISSN 0888-8809. PMID 11463856. doi:10.1210/mend.15.8.0682. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  13. Baek, Sung Hee; Ohgi, Kenneth A.; Rose, David W.; Koo, Edward H.; Glass, Christopher K.; Rosenfeld, Michael G. (12 de julio de 2002). «Exchange of N-CoR corepressor and Tip60 coactivator complexes links gene expression by NF-kappaB and beta-amyloid precursor protein». Cell 110 (1): 55-67. ISSN 0092-8674. PMID 12150997. doi:10.1016/s0092-8674(02)00809-7. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  14. Shi, Yanhong; Hon, Michelle; Evans, Ronald M. (5 de marzo de 2002). «The peroxisome proliferator-activated receptor delta, an integrator of transcriptional repression and nuclear receptor signaling». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 99 (5): 2613-2618. ISSN 0027-8424. PMID 11867749. doi:10.1073/pnas.052707099. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  15. Wen, Yu-Der; Cress, W. Douglas; Roy, Ananda L.; Seto, Edward (17 de enero de 2003). «Histone deacetylase 3 binds to and regulates the multifunctional transcription factor TFII-I». The Journal of Biological Chemistry 278 (3): 1841-1847. ISSN 0021-9258. PMID 12393887. doi:10.1074/jbc.M206528200. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  16. Tussié-Luna, María Isabel; Bayarsaihan, Dashzeveg; Seto, Edward; Ruddle, Frank H.; Roy, Ananda L. (1 de octubre de 2002). «Physical and functional interactions of histone deacetylase 3 with TFII-I family proteins and PIASxbeta». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 99 (20): 12807-12812. ISSN 0027-8424. PMID 12239342. doi:10.1073/pnas.192464499. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  17. a b Grozinger, C. M.; Hassig, C. A.; Schreiber, S. L. (27 de abril de 1999). «Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 96 (9): 4868-4873. ISSN 0027-8424. PMID 10220385. doi:10.1073/pnas.96.9.4868. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  18. a b c d Fischle, Wolfgang; Dequiedt, Franck; Hendzel, Michael J.; Guenther, Matthew G.; Lazar, Mitchell A.; Voelter, Wolfgang; Verdin, Eric (Enero de 2002). «Enzymatic activity associated with class II HDACs is dependent on a multiprotein complex containing HDAC3 and SMRT/N-CoR». Molecular Cell 9 (1): 45-57. ISSN 1097-2765. PMID 11804585. doi:10.1016/s1097-2765(01)00429-4. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  19. a b c d Zhang, Jinsong; Kalkum, Markus; Chait, Brian T.; Roeder, Robert G. (Marzo de 2002). «The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2». Molecular Cell 9 (3): 611-623. ISSN 1097-2765. PMID 11931768. doi:10.1016/s1097-2765(02)00468-9. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  20. a b Grozinger, C. M.; Schreiber, S. L. (5 de julio de 2000). «Regulation of histone deacetylase 4 and 5 and transcriptional activity by 14-3-3-dependent cellular localization». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 97 (14): 7835-7840. ISSN 0027-8424. PMID 10869435. doi:10.1073/pnas.140199597. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  21. Chen Lf, null; Fischle, W.; Verdin, E.; Greene, W. C. (31 de agosto de 2001). «Duration of nuclear NF-kappaB action regulated by reversible acetylation». Science (New York, N.Y.) 293 (5535): 1653-1657. ISSN 0036-8075. PMID 11533489. doi:10.1126/science.1062374. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  22. Mahlknecht, Ulrich; Will, Jutta; Varin, Audrey; Hoelzer, Dieter; Herbein, Georges (15 de septiembre de 2004). «Histone deacetylase 3, a class I histone deacetylase, suppresses MAPK11-mediated activating transcription factor-2 activation and represses TNF gene expression». Journal of Immunology (Baltimore, Md.: 1950) 173 (6): 3979-3990. ISSN 0022-1767. PMID 15356147. doi:10.4049/jimmunol.173.6.3979. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  23. a b Guenther, M. G.; Lane, W. S.; Fischle, W.; Verdin, E.; Lazar, M. A.; Shiekhattar, R. (1 de mayo de 2000). «A core SMRT corepressor complex containing HDAC3 and TBL1, a WD40-repeat protein linked to deafness». Genes & Development 14 (9): 1048-1057. ISSN 0890-9369. PMID 10809664. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  24. a b c Yoon, Ho-Geun; Chan, Doug W.; Reynolds, Albert B.; Qin, Jun; Wong, Jiemin (Septiembre de 2003). «N-CoR mediates DNA methylation-dependent repression through a methyl CpG binding protein Kaiso». Molecular Cell 12 (3): 723-734. ISSN 1097-2765. PMID 14527417. doi:10.1016/j.molcel.2003.08.008. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  25. a b Yoon, Ho-Geun; Chan, Doug W.; Huang, Zhi-Qing; Li, Jiwen; Fondell, Joseph D.; Qin, Jun; Wong, Jiemin (17 de marzo de 2003). «Purification and functional characterization of the human N-CoR complex: the roles of HDAC3, TBL1 and TBLR1». The EMBO journal 22 (6): 1336-1346. ISSN 0261-4189. PMID 12628926. doi:10.1093/emboj/cdg120. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  26. a b Li, J.; Wang, J.; Wang, J.; Nawaz, Z.; Liu, J. M.; Qin, J.; Wong, J. (15 de agosto de 2000). «Both corepressor proteins SMRT and N-CoR exist in large protein complexes containing HDAC3». The EMBO journal 19 (16): 4342-4350. ISSN 0261-4189. PMID 10944117. doi:10.1093/emboj/19.16.4342. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  27. a b Underhill, C.; Qutob, M. S.; Yee, S. P.; Torchia, J. (22 de diciembre de 2000). «A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1». The Journal of Biological Chemistry 275 (51): 40463-40470. ISSN 0021-9258. PMID 11013263. doi:10.1074/jbc.M007864200. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  28. Petre-Draviam, Christin E.; Williams, Erin B.; Burd, Craig J.; Gladden, Andrew; Moghadam, Hamed; Meller, Jaroslaw; Diehl, J. Alan; Knudsen, Karen E. (13 de enero de 2005). «A central domain of cyclin D1 mediates nuclear receptor corepressor activity». Oncogene 24 (3): 431-444. ISSN 0950-9232. PMID 15558026. doi:10.1038/sj.onc.1208200. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  29. Lin, Huei-Min; Zhao, Li; Cheng, Sheue-Yann (9 de agosto de 2002). «Cyclin D1 Is a Ligand-independent Co-repressor for Thyroid Hormone Receptors». The Journal of Biological Chemistry 277 (32): 28733-28741. ISSN 0021-9258. PMID 12048199. doi:10.1074/jbc.M203380200. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  30. a b Guenther, Matthew G.; Yu, Jiujiu; Kao, Gary D.; Yen, Tim J.; Lazar, Mitchell A. (15 de diciembre de 2002). «Assembly of the SMRT-histone deacetylase 3 repression complex requires the TCP-1 ring complex». Genes & Development 16 (24): 3130-3135. ISSN 0890-9369. PMID 12502735. doi:10.1101/gad.1037502. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  31. Vaute, Olivier; Nicolas, Estelle; Vandel, Laurence; Trouche, Didier (15 de enero de 2002). «Functional and physical interaction between the histone methyl transferase Suv39H1 and histone deacetylases». Nucleic Acids Research 30 (2): 475-481. ISSN 1362-4962. PMID 11788710. doi:10.1093/nar/30.2.475. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  32. Hoogeveen, André T.; Rossetti, Stefano; Stoyanova, Violeta; Schonkeren, Joris; Fenaroli, Angelia; Schiaffonati, Luisa; van Unen, Leontine; Sacchi, Nicoletta (26 de septiembre de 2002). «The transcriptional corepressor MTG16a contains a novel nucleolar targeting sequence deranged in t (16; 21)-positive myeloid malignancies». Oncogene 21 (43): 6703-6712. ISSN 0950-9232. PMID 12242670. doi:10.1038/sj.onc.1205882. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  33. Amann, J. M.; Nip, J.; Strom, D. K.; Lutterbach, B.; Harada, H.; Lenny, N.; Downing, J. R.; Meyers, S. et al. (Octubre de 2001). «ETO, a target of t(8;21) in acute leukemia, makes distinct contacts with multiple histone deacetylases and binds mSin3A through its oligomerization domain». Molecular and Cellular Biology 21 (19): 6470-6483. ISSN 0270-7306. PMID 11533236. doi:10.1128/MCB.21.19.6470-6483.2001. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  34. Yang, W. M.; Yao, Y. L.; Sun, J. M.; Davie, J. R.; Seto, E. (31 de octubre de 1997). «Isolation and characterization of cDNAs corresponding to an additional member of the human histone deacetylase gene family». The Journal of Biological Chemistry 272 (44): 28001-28007. ISSN 0021-9258. PMID 9346952. doi:10.1074/jbc.272.44.28001. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  35. Yao, Y. L.; Yang, W. M.; Seto, E. (Septiembre de 2001). «Regulation of transcription factor YY1 by acetylation and deacetylation». Molecular and Cellular Biology 21 (17): 5979-5991. ISSN 0270-7306. PMID 11486036. doi:10.1128/MCB.21.17.5979-5991.2001. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  36. Schroeder, Tania M.; Kahler, Rachel A.; Li, Xiaodong; Westendorf, Jennifer J. (1 de octubre de 2004). «Histone deacetylase 3 interacts with runx2 to repress the osteocalcin promoter and regulate osteoblast differentiation». The Journal of Biological Chemistry 279 (40): 41998-42007. ISSN 0021-9258. PMID 15292260. doi:10.1074/jbc.M403702200. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  37. Watamoto, Kouichi; Towatari, Masayuki; Ozawa, Yukiyasu; Miyata, Yasuhiko; Okamoto, Mitsunori; Abe, Akihiro; Naoe, Tomoki; Saito, Hidehiko (11 de diciembre de 2003). «Altered interaction of HDAC5 with GATA-1 during MEL cell differentiation». Oncogene 22 (57): 9176-9184. ISSN 0950-9232. PMID 14668799. doi:10.1038/sj.onc.1206902. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  38. Ozawa, Y.; Towatari, M.; Tsuzuki, S.; Hayakawa, F.; Maeda, T.; Miyata, Y.; Tanimoto, M.; Saito, H. (1 de octubre de 2001). «Histone deacetylase 3 associates with and represses the transcription factor GATA-2». Blood 98 (7): 2116-2123. ISSN 0006-4971. PMID 11567998. doi:10.1182/blood.v98.7.2116. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  39. Wu, W. S.; Vallian, S.; Seto, E.; Yang, W. M.; Edmondson, D.; Roth, S.; Chang, K. S. (Abril de 2001). «The growth suppressor PML represses transcription by functionally and physically interacting with histone deacetylases». Molecular and Cellular Biology 21 (7): 2259-2268. ISSN 0270-7306. PMID 11259576. doi:10.1128/MCB.21.7.2259-2268.2001. Consultado el 28 de mayo de 2023. 
  40. Tan, Fengwei; Lu, Lifang; Cai, Yun; Wang, Jinglan; Xie, Yunfei; Wang, Lin; Gong, Yanhua; Xu, Bing-E. et al. (Julio de 2008). «Proteomic analysis of ubiquitinated proteins in normal hepatocyte cell line Chang liver cells». Proteomics 8 (14): 2885-2896. ISSN 1615-9861. PMID 18655026. doi:10.1002/pmic.200700887. Consultado el 28 de mayo de 2023. 

Enlaces externos

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