Halspiviridae , la enciclopedia libre
Halspiviridae | ||
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Taxonomía | ||
(sin rango): | Virus fusiformes | |
Familia: | Halspiviridae | |
Clasificación de Baltimore | ||
Grupo: | I (Virus ADN bicatenario) | |
Halspiviridae es una familia de virus que infectan arqueas. Contienen un genoma ADN bicatenario y por lo tanto pertenecen al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. La especie tipo es: el Salterprovirus His1. Inicialmente los virus de esta familia se habían descrito como pertenecientes a la familia Fuselloviridae.[1]
Descripción
[editar]Los viriones tienen cápsides, con forma de limón o morfología fusiforme y una envoltura vírica. Los viriones miden entre 92 x 40 nm y tienen una cola de 12 nm. Los genomas son lineales con alrededor de 14,5 kb de longitud. El genoma tiene 35 marcos de lectura abiertos. Los genomas de ADN bicatenario constan de 14.464 pares de bases (pb), tienen secuencias repetidas terminales invertidas imperfectas de 105 pb y están anotados para llevar 35 genes codificadores de proteínas, incluido un gen que especifica una polimerasa de ADN cebada por proteínas (B- familia). Los extremos del genoma tienen una proteína adherida. La secuencia de la proteína de la polimerasa es 42% idéntica a la polimerasa especificada por los gammapleolipovirus, aunque los dos virus pertenecen a grupos taxonómicos muy diferentes.[2][3]
La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante la unión del virus a la célula huésped. La transcripción con plantilla de ADN es el método de transcripción. Las arqueas sirven como huéspedes naturales. Las rutas de transmisión son por difusión pasiva.[2]
Taxonomía
[editar]Contiene los siguientes géneros:
Evolución
[editar]En cuanto a la relación con otros virus, Haslpiviridae muestra una relación muy estrecha con otros virus que infectan arqueas como Fuselloviridae, Thaspiviridae, Itzamnaviridae y Bicaudaviridae con quienes comparte la misma morfología del virión, el ensamblaje, una proteína de cápside homóloga la SSV1 de cuatro hélices y ATPasas de la superfamilia AAA, estos últimos se les conoce como "virus en forma de huso o fusiformes". La proteína homóloga de estos virus también se encuentra en la familia de virus arqueanos filamentosos Clavaviridae, por lo que se ha sugerido que los virus fusiformes evolucionaron de virus filamentosos emparentados con Clavaviridae para almacenar un genoma más grande por lo que conformarían un dominio o linaje viral, la misma ruta se ha propuesto para los otros virus inusuales de arqueas.[6] Específicamente la relación entre Halspiviridae y Thaspiviridae es aun más estrecha ya que además de compartir las características mencionadas, también comparten una ADN polimerasa B homóloga, genomas lineales y sus genomas están relacionados con los transposones capsones en contraposición con los virus fusiformes de la familia Fuselloviridae, Itzamnaviridae y Bicaudaviridae cuyos genomas son circulares y están relacionados con plásmidos.[7]
Referencias
[editar]- ↑ Adriaenssens EM, Sullivan MB, Knezevic P, van Zyl LJ, Sarkar BL, Dutilh BE, Alfenas-Zerbini P, Łobocka M, Tong Y, Brister JR, Moreno Switt AI, Klumpp J, Aziz RK, Barylski J, Uchiyama J, Edwards RA, Kropinski AM, Petty NK, Clokie MR, Kushkina AI, Morozova VV, Duffy S, Gillis A, Rumnieks J, Kurtböke İ, Chanishvili N, Goodridge L, Wittmann J, Lavigne R, Jang HB, Prangishvili D, Enault F, Turner D, Poranen MM, Oksanen HM, Krupovic M (May 2020). «Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018-2019 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee». Archives of Virology 165 (5): 1253-1260. PMID 32162068. doi:10.1007/s00705-020-04577-8.
- ↑ a b «Viral Zone». ExPASy. Consultado el 15 de junio de 2015.
- ↑ Bath C, Cukalac T, Porter K, Dyall-Smith ML (June 2006). «His1 and His2 are distantly related, spindle-shaped haloviruses belonging to the novel virus group, Salterprovirus». Virology 350 (1): 228-39. PMID 16530800. doi:10.1016/j.virol.2006.02.005.
- ↑ «Taxonomy History - Taxonomy - ICTV». talk.ictvonline.org. Consultado el 8 de septiembre de 2021.
- ↑ Sofia Medvedeva, Jiarui Sun, Natalya Yutin, Eugene V. Koonin, Takuro Nunoura, Christian Rinke, Mart Krupovic. (2021). Viruses of Asgard archaea. Biorxiv.
- ↑ Fengbin Wang, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Matthijn Vos, Leticia C Beltran, Mark A B Kreutzberger, Jean-Marie Winter, Zhangli Su, Jun Liu, Stefan Schouten, Mart Krupovic, Edward H Egelman (2022) Spindle-shaped archaeal viruses evolved from rod-shaped ancestors to package a larger genome. Sciences Direct.
- ↑ Kim, JG; Kim, SJ; Cvirkaite-Krupovic, V; Yu, WJ; Gwak, JH; López-Pérez, M; Rodriguez-Valera, F; Krupovic, M; Cho, JC; Rhee, SK (2019). «Spindle-shaped viruses infect marine ammonia-oxidizing thaumarchaea.». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 116 (31): 15645-15650. PMC 6681747. PMID 31311861. doi:10.1073/pnas.1905682116.