Nocardia sputorum — Wikipédia
Domaine | Bacteria |
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Phylum | Actinomycetota |
Classe | Actinomycetes |
Ordre | Mycobacteriales |
Famille | Nocardiaceae |
Genre | Nocardia |
Nocardia sputorum est une espèce de bactéries gram positives de la famille des Nocardiaceae qui a été identifiée au Japon dans échantillons cliniques de crachats.
Historique
[modifier | modifier le code]Cette bactérie a été initialement décrite sur la base de deux souches isolées de prélèvements cliniques dans des crachats de patients[1].
Description
[modifier | modifier le code]Les souches bactériennes de cette espèce N. sputorum sont des actinomycètes non mobiles, aérobies à Gram positif[2].
Les hydrolysats cellulaires totaux présentent des quantités d'acide meso-diaminopimélique, d'arabinose et de galactose caractéristiques des Nocardiaceae[2].
Elles possèdent un acide muramique de type N-glycolyl. La quinone isoprénoide majoritaire est la MK-8(H4, ω-cycl.) principaux lipides sont le diphosphatidylglycérol, le phosphatidyléthanolamine, le phosphatidylinositol et le phosphatidylinositol mannosides[2].
Taxonomie
[modifier | modifier le code]Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Nocardia sputorum Hamada et al. 2023[3],[2].
La souche type de cette espèce est la souche IFM 12276, déposée sous la référence NBRC 115477 et TBRC 17096 dans deux banques de cultures bactériennes. Une seconde souche, IFM 12275 a aussi été caractérisée lors de la description originale de la nouvelle espèce[2].
Étymologie
[modifier | modifier le code]L'étymologie du nom spécifique de N. sputorum est la suivante : spu.to’rum. L. neut. n. sputum, crachat; L. gen. neut. pl. n. sputorum, d'un crachat[3],[2].
Phylogénie
[modifier | modifier le code]L'analyse phylogénique de la séquence de l'ARN ribosomal 16S a permis de classer la souche IFM 12276 dans la famille Nocardiaceae et le genre Nocardia. Cette souche présente une similarité maximale de 99,6 % avec les espèces N. beijingensis et N. sputipour cette même séquence. Ensuite, la similarité de séquence reste élevée avec 99,3 % avec les espèces N. niwae et N. araoensis. Les acides mycoliques de cette espèce co-migrent avec ceux de l'espèce N. niwae mais l'espèce N. sputorum peut être différenciée de cette dernière et des autres espèces du genre Nocardia par un ensemble de caractéristiques chimiotaxonomiques[2].
Références
[modifier | modifier le code]Bibliographie
[modifier | modifier le code]- (en) Moriyuki Hamada, Narumi Enomoto, Tomonari Yamashita, Masahiro Shimojima, Daiki Tanno, Noboru Ohana, Masahiro Toyokawa, Hiroki Takahashi et Takashi Yaguchi, « Nocardia sputorum sp. nov., an actinobacterium isolated from clinical specimens in Japan », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Society for General Microbiology (d), vol. 73, no 6, (ISSN 1466-5026 et 1466-5034, OCLC 807119723, DOI 10.1099/IJSEM.0.005935).
Liens externes
[modifier | modifier le code]- (en) Référence LPSN : Nocardia sputorum Hamada et al. 2023 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Nocardia sputorum (taxons inclus) (consulté le )