龜的分類方法有許多，以下為三種龜鱉目（Testudines）和龜鱉亞綱（Testudinata）分類。
下面顯示的是托馬斯和謝弗（Thomson and Shaffer）在2010年給出的進化分支圖：[1]
| | | Pleurodira | | | | | | | Trionychia | | | | | | 見下文的鱷龜科（Chelydridae）、海龜總科（Chelonioidea）、動胸龜總科（Kinosternoidea）、平胸龜科（Platysternidae）、澤龜科（Emydidae）、陸龜科（Testudinidae）和地龜科（Geoemydidae） | | | | | | |
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下面顯示的是斯特林（Sterli）在2010年給出的進化分支圖：[2]
下面顯示的是喬伊斯（Joyce）在2007年給出的進化分支圖：[3]
- ^ Thomson, R.C. & Shaffer, H.B. Sparse Supermatrices for Phylogenetic Inference: Taxonomy, Alignment, Rogue Taxa, and the Phylogeny of Living Turtles (PDF). Systematic Biology. 2010, 59 (1): 42–58 [2014-12-14]. doi:10.1093/sysbio/syp075. （原始内容 (PDF)存档于2010-11-21）.
- ^ Sterli, J. Phylogenetic relationships among extinct and extant turtles: the position of Pleurodira and the effects of the fossils on rooting crown-group turtles. Contributions to Zoology. 2010, 79 (3): 93–106.
- ^ Joyce, W.G. Phylogenetic Relationships of Mesozoic Turtles (PDF). Bulletin of the Peabody Museum of Natural History. 2007, 48 (1): 62 [2014-12-14]. （原始内容 (PDF)存档于2013-06-06）.
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