PKD2 — Вікіпедія
PKD2 (англ. Polycystin 2, transient receptor potential cation channel) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 968 амінокислот, а молекулярна маса — 109 691[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MVNSSRVQPQ | QPGDAKRPPA | PRAPDPGRLM | AGCAAVGASL | AAPGGLCEQR | ||||
GLEIEMQRIR | QAAARDPPAG | AAASPSPPLS | SCSRQAWSRD | NPGFEAEEEE | ||||
EEVEGEEGGM | VVEMDVEWRP | GSRRSAASSA | VSSVGARSRG | LGGYHGAGHP | ||||
SGRRRRREDQ | GPPCPSPVGG | GDPLHRHLPL | EGQPPRVAWA | ERLVRGLRGL | ||||
WGTRLMEESS | TNREKYLKSV | LRELVTYLLF | LIVLCILTYG | MMSSNVYYYT | ||||
RMMSQLFLDT | PVSKTEKTNF | KTLSSMEDFW | KFTEGSLLDG | LYWKMQPSNQ | ||||
TEADNRSFIF | YENLLLGVPR | IRQLRVRNGS | CSIPQDLRDE | IKECYDVYSV | ||||
SSEDRAPFGP | RNGTAWIYTS | EKDLNGSSHW | GIIATYSGAG | YYLDLSRTRE | ||||
ETAAQVASLK | KNVWLDRGTR | ATFIDFSVYN | ANINLFCVVR | LLVEFPATGG | ||||
VIPSWQFQPL | KLIRYVTTFD | FFLAACEIIF | CFFIFYYVVE | EILEIRIHKL | ||||
HYFRSFWNCL | DVVIVVLSVV | AIGINIYRTS | NVEVLLQFLE | DQNTFPNFEH | ||||
LAYWQIQFNN | IAAVTVFFVW | IKLFKFINFN | RTMSQLSTTM | SRCAKDLFGF | ||||
AIMFFIIFLA | YAQLAYLVFG | TQVDDFSTFQ | ECIFTQFRII | LGDINFAEIE | ||||
EANRVLGPIY | FTTFVFFMFF | ILLNMFLAII | NDTYSEVKSD | LAQQKAEMEL | ||||
SDLIRKGYHK | ALVKLKLKKN | TVDDISESLR | QGGGKLNFDE | LRQDLKGKGH | ||||
TDAEIEAIFT | KYDQDGDQEL | TEHEHQQMRD | DLEKEREDLD | LDHSSLPRPM | ||||
SSRSFPRSLD | DSEEDDDEDS | GHSSRRRGSI | SSGVSYEEFQ | VLVRRVDRME | ||||
HSIGSIVSKI | DAVIVKLEIM | ERAKLKRREV | LGRLLDGVAE | DERLGRDSEI | ||||
HREQMERLVR | EELERWESDD | AASQISHGLG | TPVGLNGQPR | PRSSRPSSSQ | ||||
STEGMEGAGG | NGSSNVHV |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт кальцію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, війках, цитоплазматичних везикулах.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gallagher A.R., Cedzich A., Gretz N., Somlo S., Witzgall R. (2000). The polycystic kidney disease protein PKD2 interacts with Hax-1, a protein associated with the actin cytoskeleton. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 4017—4022. PMID 10760273 DOI:10.1073/pnas.97.8.4017
- Stayner C., Zhou J. (2001). Polycystin channels and kidney disease. Trends Pharmacol. Sci. 22: 543—546. PMID 11698076 DOI:10.1016/S0165-6147(00)01832-0
- Streets A.J., Moon D.J., Kane M.E., Obara T., Ong A.C. (2006). Identification of an N-terminal glycogen synthase kinase 3 phosphorylation site which regulates the functional localization of polycystin-2 in vivo and in vitro. Hum. Mol. Genet. 15: 1465—1473. PMID 16551655 DOI:10.1093/hmg/ddl070
- Streets A.J., Needham A.J., Gill S.K., Ong A.C. (2010). Protein kinase D-mediated phosphorylation of polycystin-2 (TRPP2) is essential for its effects on cell growth and calcium channel activity. Mol. Biol. Cell. 21: 3853—3865. PMID 20881056 DOI:10.1091/mbc.E10-04-0377
- del Rocio Cantero M., Velazquez I.F., Streets A.J., Ong A.C.M., Cantiello H.F. (2015). The cAMP Signaling Pathway and Direct Protein Kinase A Phosphorylation Regulate Polycystin-2 (TRPP2) Channel Function. J. Biol. Chem. 290: 23888—23896. PMID 26269590 DOI:10.1074/jbc.M115.661082
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PKD2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9009 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q13563 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|