HOXB5 Ідентифікатори Символи HOXB5 , HHO.C10, HOX2, HOX2A, HU-1, Hox2.1, homeobox B5 Зовнішні ІД OMIM : 142960 MGI: 96186 HomoloGene: 37585 GeneCards: HOXB5 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
Клітинна компонента • fibrillar center • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • embryonic skeletal system development • endothelial cell differentiation • anterior/posterior pattern specification • embryonic skeletal system morphogenesis • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 17: 48.59 – 48.59 Mb Хр. 11: 96.19 – 96.2 Mb PubMed search [1] [2] Вікідані
HOXB5 (англ. Homeobox B5 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 269 амінокислот , а молекулярна маса — 29 434[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSSYFVNSFS GRYPNGPDYQ LLNYGSGSSL SGSYRDPAAM HTGSYGYNYN GMDLSVNRSS ASSSHFGAVG ESSRAFPAPA QEPRFRQAAS SCSLSSPESL PCTNGDSHGA KPSASSPSDQ ATSASSSANF TEIDEASASS EPEEAASQLS SPSLARAQPE PMATSTAAPE GQTPQIFPWM RKLHISHDMT GPDGKRARTA YTRYQTLELE KEFHFNRYLT RRRRIEIAHA LCLSERQIKI WFQNRRMKWK KDNKLKSMSL ATAGSAFQP
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку . Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції . Білок має сайт для зв'язування з ДНК . Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504 Levine M., Rubin G.M., Tjian R. (1984). Human DNA sequences homologous to a protein coding region conserved between homeotic genes of Drosophila. Cell . 38 : 667—673. PMID 6091895 DOI :10.1016/0092-8674(84)90261-7 Galang C.K., Hauser C.A. (1992). Cooperative DNA binding of the highly conserved human Hox 2.1 homeodomain gene product. New Biol . 4 : 558—568. PMID 1355360
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер (2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль (3.4) Фактори теплового шоку (3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR (4.2) STAT (4.3) p53 (4.4) MADS (4.6) TATA (4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні (0.6) Інші