HOXD11 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | HOXD11, HOX4, HOX4F, homeobox D11 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 142986 MGI: 96203 HomoloGene: 7368 GeneCards: HOXD11 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • branching involved in ureteric bud morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • dorsal/ventral pattern formation • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 176.1 – 176.11 Mb | Хр. 2: 74.51 – 74.52 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
|
HOXD11 (англ. Homeobox D11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 35 197[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNDFDECGQS | | AASMYLPGCA | | YYVAPSDFAS | | KPSFLSQPSS | | CQMTFPYSSN |
LAPHVQPVRE | | VAFRDYGLER | | AKWPYRGGGG | | GGSAGGGSSG | | GGPGGGGGGA |
GGYAPYYAAA | | AAAAAAAAAA | | EEAAMQRELL | | PPAGRRPDVL | | FKAPEPVCAA |
PGPPHGPAGA | | ASNFYSAVGR | | NGILPQGFDQ | | FYEAAPGPPF | | AGPQPPPPPA |
PPQPEGAADK | | GDPRTGAGGG | | GGSPCTKATP | | GSEPKGAAEG | | SGGDGEGPPG |
EAGAEKSSSA | | VAPQRSRKKR | | CPYTKYQIRE | | LEREFFFNVY | | INKEKRLQLS |
RMLNLTDRQV | | KIWFQNRRMK | | EKKLNRDRLQ | | YFTGNPLF |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | |
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|