ZEB1 — Вікіпедія

ZEB1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ZEB1, zinc finger E-box binding homeobox 1, AREB6, BZP, DELTAEF1, FECD6, NIL2A, PPCD3, TCF8, ZFHEP, ZFHX1A
Зовнішні ІД OMIM: 189909 MGI: 1344313 HomoloGene: 31779 GeneCards: ZEB1
Пов'язані генетичні захворювання
Fuchs' endothelial dystrophy[1]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_011546
NM_001360981
NM_001360982
RefSeq (білок)
NP_035676
NP_001347910
NP_001347911
Локус (UCSC) Хр. 10: 31.32 – 31.53 Mb Хр. 18: 5.59 – 5.78 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ZEB1 (англ. Zinc finger E-box binding homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 124 амінокислот, а молекулярна маса — 124 074[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MADGPRCKRRKQANPRRNNVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDA
ADCEGVPEDDLPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDDRKEGQEILGPEAQA
DEAGCTVKDDECESDAENEQNHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQG
TPEASGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNF
SCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGCNRKFKCTECGKAFK
YKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLIPVNG
RPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEP
VDYEFKPIVVASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVG
LVSPISINLSDIQNVLKVAVDGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQ
QGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLEQPSQLQVVPQNLKKENPVAT
NSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPGDINALPELKHY
DLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAYY
ALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSEPSSPEPG
KVNIPAKNNDQPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSRS
STPSPSPLNLSSSRNTQGYLYTAEGAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERS
TITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQKDSCVTDSEPVVNVIPPSANPI
NIAIPTVTAQLPTIVAIADQNSVPCLRALAANKQTILIPQVAYTYSTTVS
PAVQEPPLKVIQPNGNQDERQDTSSEGVSNVEDQNDSDSTPPKKKMRKTE
NGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKKAFKHKHHLIEH
MRLHSGEKPYQCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEERDSTEQEE
AGPEILSNEHVGARASPSQGDSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEEL
QEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEEAENEGEEAKTEGLMKDDRAES
QASSLGQKVGESSEQVSEEKTNEA

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin. J. Biol. Chem. 280: 35477—35489. PMID 16061479 DOI:10.1074/jbc.M504477200
  • Papadopoulou V., Postigo A., Sanchez-Tillo E., Porter A.C., Wagner S.D. (2010). ZEB1 and CtBP form a repressive complex at a distal promoter element of the BCL6 locus. Biochem. J. 427: 541—550. PMID 20175752 DOI:10.1042/BJ20091578
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
  • Chung D.W., Frausto R.F., Ann L.B., Jang M.S., Aldave A.J. (2014). Functional impact of ZEB1 mutations associated with posterior polymorphous and Fuchs' endothelial corneal dystrophies. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 55: 6159—6166. PMID 25190660 DOI:10.1167/iovs.14-15247

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з ZEB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11642 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, P37275 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]