SOX21 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SOX21, SOX25, SRY-box 21, SRY-box transcription factor 21 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604974 MGI: 2654070 HomoloGene: 5143 GeneCards: SOX21 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • компонент клітини |
---|
Біологічний процес | • hair follicle development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • hair cycle • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • skin development • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • central nervous system development • neuron differentiation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 94.71 – 94.71 Mb | Хр. 14: 118.47 – 118.47 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
|
SOX21 (англ. SRY-box 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 276 амінокислот, а молекулярна маса — 28 580[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSKPVDHVKR | | PMNAFMVWSR | | AQRRKMAQEN | | PKMHNSEISK | | RLGAEWKLLT |
ESEKRPFIDE | | AKRLRAMHMK | | EHPDYKYRPR | | RKPKTLLKKD | | KFAFPVPYGL |
GGVADAEHPA | | LKAGAGLHAG | | AGGGLVPESL | | LANPEKAAAA | | AAAAAARVFF |
PQSAAAAAAA | | AAAAAAGSPY | | SLLDLGSKMA | | EISSSSSGLP | | YASSLGYPTA |
GAGAFHGAAA | | AAAAAAAAAG | | GHTHSHPSPG | | NPGYMIPCNC | | SAWPSPGLQP |
PLAYILLPGM | | GKPQLDPYPA | | AYAAAL |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
- Malas S., Duthie S., Deloukas P., Episkopou V. (1999). The isolation and high-resolution chromosomal mapping of human SOX14 and SOX21; two members of the SOX gene family related to SOX1, SOX2, and SOX3. Mamm. Genome. 10: 934—937. PMID 10441749 DOI:10.1007/s003359901118
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|