NR1H4 — Вікіпедія

NR1H4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NR1H4, BAR, FXR, HRR-1, HRR1, RIP14, nuclear receptor subfamily 1 group H member 4, PFIC5
Зовнішні ІД OMIM: 603826 MGI: 1352464 HomoloGene: 3760 GeneCards: NR1H4
Реагує на сполуку
chenodiol, fexaramine, obeticholic acid, (E)-guggulsterone[1]
nidufexor[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001163504
NM_001163700
NM_009108
NM_001385711
RefSeq (білок)
NP_001156976
NP_001157172
NP_033134
NP_001372640
Локус (UCSC) Хр. 12: 100.47 – 100.56 Mb Хр. 10: 89.29 – 89.37 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NR1H4 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 486 амінокислот, а молекулярна маса — 55 914[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVMQFQGLENPIQISPHCSCTPSGFFMEMMSMKPAKGVLTEQVAGPLGQN
LEVEPYSQYSNVQFPQVQPQISSSSYYSNLGFYPQQPEEWYSPGIYELRR
MPAETLYQGETEVAEMPVTKKPRMGASAGRIKGDELCVVCGDRASGYHYN
ALTCEGCKGFFRRSITKNAVYKCKNGGNCVMDMYMRRKCQECRLRKCKEM
GMLAECMYTGLLTEIQCKSKRLRKNVKQHADQTVNEDSEGRDLRQVTSTT
KSCREKTELTPDQQTLLHFIMDSYNKQRMPQEITNKILKEEFSAEENFLI
LTEMATNHVQVLVEFTKKLPGFQTLDHEDQIALLKGSAVEAMFLRSAEIF
NKKLPSGHSDLLEERIRNSGISDEYITPMFSFYKSIGELKMTQEEYALLT
AIVILSPDRQYIKDREAVEKLQEPLLDVLQKLCKIHQPENPQHFACLLGR
LTELRTFNHHHAEMLMSWRVNDHKFTPLLCEIWDVQ

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kanaya E., Shiraki T., Jingami H. (2004). The nuclear bile acid receptor FXR is activated by PGC-1alpha in a ligand-dependent manner. Biochem. J. 382: 913—921. PMID 15202934 DOI:10.1042/BJ20040432
  • Neimark E., Chen F., Li X., Shneider B.L. (2004). Bile acid-induced negative feedback regulation of the human ileal bile acid transporter. Hepatology. 40: 149—156. PMID 15239098 DOI:10.1002/hep.20295
  • Pineda Torra I., Freedman L.P., Garabedian M.J. (2004). Identification of DRIP205 as a coactivator for the Farnesoid X receptor. J. Biol. Chem. 279: 36184—36191. PMID 15187081 DOI:10.1074/jbc.M405126200
  • Hirokane H., Nakahara M., Tachibana S., Shimizu M., Sato R. (2004). Bile acid reduces the secretion of very low density lipoprotein by repressing microsomal triglyceride transfer protein gene expression mediated by hepatocyte nuclear factor-4. J. Biol. Chem. 279: 45685—45692. PMID 15337761 DOI:10.1074/jbc.M404255200
  • Ananthanarayanan M., Li S., Balasubramaniyan N., Suchy F.J., Walsh M.J. (2004). Ligand-dependent activation of the farnesoid X-receptor directs arginine methylation of histone H3 by CARM1. J. Biol. Chem. 279: 54348—54357. PMID 15471871 DOI:10.1074/jbc.M410021200

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]