KLF10 Ідентифікатори Символи KLF10 , EGR-alpha, EGRA, TIEG, TIEG1, Kruppel-like factor 10, Kruppel like factor 10 Зовнішні ІД OMIM : 601878 MGI: 1101353 HomoloGene: 4135 GeneCards: KLF10 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • клітинне ядро
Біологічний процес • skeletal system development • bone mineralization • cellular response to peptide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • ритмічний процес • cell-cell signaling • positive regulation of osteoclast differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • циркадний ритм • проліферація • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to starvation • regulation of circadian rhythm • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 8: 102.65 – 102.66 Mb Хр. 15: 38.29 – 38.3 Mb PubMed search [ 1] [ 2] Вікідані
KLF10 (англ. Kruppel like factor 10 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот , а молекулярна маса — 52 555[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MLNFGASLQQ TAEERMEMIS ERPKESMYSW NKTAEKSDFE AVEALMSMSC SWKSDFKKYV ENRPVTPVSD LSEEENLLPG TPDFHTIPAF CLTPPYSPSD FEPSQVSNLM APAPSTVHFK SLSDTAKPHI AAPFKEEEKS PVSAPKLPKA QATSVIRHTA DAQLCNHQTC PMKAASILNY QNNSFRRRTH LNVEAARKNI PCAAVSPNRS KCERNTVADV DEKASAALYD FSVPSSETVI CRSQPAPVSP QQKSVLVSPP AVSAGGVPPM PVICQMVPLP ANNPVVTTVV PSTPPSQPPA VCPPVVFMGT QVPKGAVMFV VPQPVVQSSK PPVVSPNGTR LSPIAPAPGF SPSAAKVTPQ IDSSRIRSHI CSHPGCGKTY FKSSHLKAHT RTHTGEKPFS CSWKGCERRF ARSDELSRHR RTHTGEKKFA CPMCDRRFMR SDHLTKHARR HLSAKKLPNW QMEVSKLNDI ALPPTPAPTQ
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біологічні ритми, альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК . Локалізований у ядрі .
Blok L.J., Grossmann M.E., Perry J.E., Tindall D.J. (1995). Characterization of an early growth response gene, which encodes a zinc finger transcription factor, potentially involved in cell cycle regulation. Mol. Endocrinol . 9 : 1610—1620. PMID 8584037 DOI :10.1210/mend.9.11.8584037 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504 Johnsen S.A., Subramaniam M., Monroe D.G., Janknecht R., Spelsberg T.C. (2002). Modulation of transforming growth factor beta (TGFbeta)/Smad transcriptional responses through targeted degradation of TGFbeta-inducible early gene-1 by human seven in absentia homologue. J. Biol. Chem . 277 : 30754—30759. PMID 12072443 DOI :10.1074/jbc.M204812200 Chrisman H.R., Tindall D.J. (2003). Identification and characterization of a consensus DNA binding element for the zinc finger transcription factor TIEG/EGRalpha. DNA Cell Biol . 22 : 187—199. PMID 12804117 DOI :10.1089/104454903321655819
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер (2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль (3.4) Фактори теплового шоку (3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR (4.2) STAT (4.3) p53 (4.4) MADS (4.6) TATA (4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні (0.6) Інші